Isis
Moherator
Dołączył: 24 Wrz 2006
Posty: 508
Przeczytał: 0 tematów
Pomógł: 1 raz
Ostrzeżeń: 0/5
Skąd: Świdnica
|
 Wysłany: Pon 23:50, 25 Lut 2008 Temat postu: Projektowanie primerów: jak ktoś coś wie to help please :P |
|
|
Mam problem. Ślicznie mi się podobierały primery do PCR... ale jeden bubek ma brzydki homodimer. sparowanie 6nt na 20, przy czym polowa to pary GC. Energia Gibbsa dla pary to grubo ponad -5 (kolo -10) i co mam z tym fantem zrobic?
Dimer wyglada tak:
5' TTCATGACTGCAGCTTCTTT 3'
||||||
3' TTTCTTCGACGTCAGTACTT 5'
Jest dziwny bo idealnie symetrycznie sie primer uklada no iwg jednego z programow takie sparowanie jest ok bo struktura jest nie trwala, ale IDT podaje mi cos wprost przeciwnego...
Warto ryzykować? Nie chce mi sie szukac dalej bo reszta parametrow jest perfecta ;(
Post został pochwalony 0 razy
Ostatnio zmieniony przez Isis dnia Pon 23:52, 25 Lut 2008, w całości zmieniany 3 razy
|
|
